Medicinski fakultet Univerziteta u Nišu osnovan je 1960. godine odlukom Narodne skupštine Narodne Republike Srbije. Nastava je počela iste godine, sa upisom 204 studenta na medicinski i stomatološki odsek. Fakultet je deo Univerziteta u Nišu od 1965. godine.
Fakultet se nalazi na adresi Bulevar dr Zorana Đinđića 81 u Nišu. Ima više od 3.000 studenata i oko 350 zaposlenih, uključujući nastavno i naučno osoblje.
Nastava se izvodi na osnovnim, master, doktorskim, specijalističkim i strukovnim studijama. Programi obuhvataju medicinu, stomatologiju, farmaciju i druge oblasti zdravstvenih nauka. Saradnja je uspostavljena sa Kliničkim centrom Niš i drugim zdravstvenim ustanovama. Fakultet je akreditovan i usklađen sa Bolonjskom deklaracijom.
