Babuna reka izvire na padinama planine Jakupice, ispod Solunske Glave, i teče kroz centralni deo Severne Makedonije.
Njena dužina iznosi oko 60 km. Najveći deo toka protiče kroz zelene doline i kanjone, sve do ušća u Vardar kod sela Gradsko.
Babuna je poznata po izvorima kod sela Nežilovo, gde izbija iz stena u snažnim vodenim mlazevima, stvarajući slikovit prizor.
Tok reke je brz i bistar, a okružen je šumama, stenama i planinskim livadama.
U letnjim mesecima reka je omiljena za izlete, kupanje i planinarenje.
Babuna takođe ima istorijski značaj – u njenoj dolini nalaze se ostaci srednjovekovnih naselja i crkava.